Mdl number что это

Химический формат файла — Chemical file format

В этой статье обсуждаются некоторые распространенные форматы молекулярных файлов , включая использование и преобразование между ними.

Содержание

Отличительные форматы

Химическая информация обычно предоставляется в виде файлов или потоки и множество форматов были созданы с разной степенью документации. Формат указывается тремя способами (см. Химический раздел MIME).

• расширение файла (обычно 3 буквы). Это широко используется, но хрупко, поскольку общие суффиксы, такие как «.mol» и «.dat», используются во многих системах, в том числе нехимических.
• файлы с самоописанием, в которых информация о формате включена в файл. Примерами являются CIF и CML.
• химический / MIME-тип, добавленный химически осведомленным сервером.

Язык химической разметки

Язык химической разметки (CML) — это открытый стандарт для представления молекулярных и другие химические данные. Проект с открытым исходным кодом включает XML-схему, исходный код для анализа и работы с данными CML, а также активное сообщество. В статьях «Инструменты для работы с языком химической разметки» и «XML для химии и биологических наук» CML обсуждается более подробно. Файлы данных CML поддерживаются многими инструментами, в том числе JChemPaint , Jmol , XDrawChem и MarvinView.

Формат банка данных о белках

Формат банка данных о белках обычно используется для белков, но его можно использовать и для других типов молекул. Первоначально он был разработан и остается форматом с фиксированной шириной столбца и, таким образом, официально имеет встроенное максимальное количество атомов, остатков и цепей; это привело к разделению очень больших структур, таких как рибосомы, на несколько файлов. Однако многие инструменты могут читать файлы, превышающие эти ограничения. Например, в 2009 г. рибосома E. coli 70S была представлена ​​в виде 4 файлов PDB: 3I1M , 3I1N , 3I1O и 3I1P. В 2014 году они были объединены в один файл, 4V6C .

Некоторые файлы PDB содержат дополнительный раздел, описывающий связь атома, а также положение. Поскольку эти файлы иногда используются для описания макромолекулярных сборок или молекул, представленных в явном растворителе , они могут становиться очень большими и часто сжимаются. Некоторые инструменты, такие как Jmol и KiNG, могут читать файлы PDB в формате gzip. WwPDB поддерживает спецификации формата файла PDB и его альтернативы XML, PDBML. В августе 2007 г. произошли довольно серьезные изменения в спецификации формата PDB (до версии 3.0) и устранены многие проблемы с файлами в существующей базе данных. Типичное расширение файла для файла PDB — .pdb, хотя некоторые старые файлы используют .ent или .brk. Некоторые инструменты молекулярного моделирования записывают нестандартные файлы в стиле PDB, которые адаптируют базовый формат к своим потребностям.

Формат GROMACS

Семейство форматов файлов GROMACS было создано для использования с программным пакетом молекулярного моделирования GROMACS . Он очень похож на формат PDB, но был разработан для хранения результатов моделирования молекулярной динамики , поэтому он обеспечивает дополнительную числовую точность и, при необходимости, сохраняет информацию о скорости частицы, а также о положении в заданном точка на траектории моделирования. Он не позволяет хранить информацию о подключении, которая в GROMACS получается из отдельных файлов молекулы и системной топологии. Типичное расширение файла GROMACS — .gro.

Формат CHARMM

Пакет молекулярной динамики CHARMM может считывать и записывать ряд стандартных химических и биохимических форматов файлов; однако CARD (координата) и PSF (файл структуры белка ) в значительной степени уникальны для CHARMM. Формат CARD имеет фиксированную ширину столбца, напоминает формат PDB и используется исключительно для хранения атомарных координат. Файл PSF содержит информацию об атомных связях (которая описывает атомные связи) и требуется перед началом моделирования. Обычно используются файлы с расширениями .crd и .psf соответственно.

Формат GSD

Формат файла общих данных моделирования (GSD), созданный для эффективного чтения / записи общих имитаций частиц, в первую очередь — но не ограничиваясь — теми из них. Пакет также содержит модуль python, который читает и записывает gsd-файлы схемы hoomd с простым в использовании синтаксисом. [1]

Формат файла Ghemical

Программное обеспечение Ghemical может использовать OpenBabel для импорта и экспорта ряда форматов файлов. Однако по умолчанию он использует формат GPR. Этот файл состоит из нескольких частей, разделенных тегом (! Header,! Info,! Atoms,! Bonds,! Coord,! PartialCharges и! End).

Предлагаемый тип MIME для этого формата — application / x-ghemical.

Обозначение строки SYBYL

Обозначение строки SYBYL (SLN) — это химическое обозначение строки . Основанный на SMILES, он включает полный синтаксис для определения относительной стереохимии. SLN имеет богатый синтаксис запросов, который позволяет специфицировать запросы структуры Маркуша . Синтаксис также поддерживает спецификацию комбинаторных библиотек ChemDraw.

УЛЫБКА

Атомы водорода не представлены. Другие атомы представлены символами их элементов B, C, N, O, F, P, S, Cl, Br и I. Символ «=» представляет двойные связи, а «#» представляет тройные связи. Ветвление обозначено (). Кольца обозначаются парами цифр.

Формат файла XYZ — это простой формат, который обычно дает количество атомов в первом строка, комментарий ко второй, за которым следует ряд строк с атомными символами (или атомными числами) и декартовыми координатами.

Номер MDL

Номер MDL содержит уникальный идентификационный номер для каждой реакции и варианта. Формат — RXXXnnnnnnnn. R указывает на реакцию, XXX указывает, какая база данных содержит запись реакции. Числовая часть, nnnnnnnn, представляет собой 8-значное число.

Другие распространенные форматы

Одним из наиболее широко используемых промышленных стандартов являются форматы файлов химических таблиц , такие как файлы формата данных структуры (SDF). Это текстовые файлы, которые соответствуют строгому формату для представления нескольких записей химической структуры и связанных полей данных. Формат был первоначально разработан и опубликован Molecular Design Limited (MDL). MOL — это еще один формат файлов от MDL. Он задокументирован в главе 4 документа CTfile Formats.

PubChem также имеет форматы файлов XML и ASN1, которые представляют собой параметры экспорта из онлайн-базы данных PubChem. Оба они основаны на тексте (чаще всего ASN1 — это двоичный формат).

В таблице ниже перечислено большое количество других форматов.

Преобразование между форматами

OpenBabel и JOELib являются свободно доступными инструментами с открытым исходным кодом, в частности предназначен для преобразования между форматами файлов. Их химические экспертные системы поддерживают большие таблицы преобразования типов атомов.

babel -i input_format input_file -o output_format output_file

Например, чтобы преобразовать файл epinephrine.sdf из SDF в CML, используйте команду

babel -i sdf epinephrine.sdf -o cml epinephrine.cml

Полученный файл — epinephrine.cml.

Ряд инструментов, предназначенных для просмотра и редактирования молекулярных структур, могут читать файлы в нескольких форматах и ​​записывать их в других форматах. Инструменты JChemPaint (на основе Chemistry Development Kit ), XDrawChem (на основе OpenBabel ), Chime , Jmol , Mol2mol и Discovery Studio попадают в эту категорию.

Проект Chemical MIME

«Химический MIME» — это де-факто подход для добавления типов MIME к химическим потокам.

Этот проект стартовал в январе 1994 г. и впервые был объявлен во время семинара по химии на Первой международной конференции WWW, состоявшейся в ЦЕРНе в мае 1994 г. . Первая версия черновика в Интернете была опубликована в мае – октябре 1994 г. и вторая исправленная версия в период с апреля по сентябрь 1995 г. Документ, представленный CPEP (Комитет по печатным и электронным публикациям) на заседании IUPAC в августе 1996 г., доступен для обсуждения.

В 1998 г. работа была официально опубликована в JCIM .

Поддержка

Для Linux / Unix файлы конфигурации доступны в виде пакета «chemical-mime-data» в .deb , RPM и форматы tar.gz для регистрации химических типов MIME на веб-сервере. Затем программы могут зарегистрироваться в качестве средства просмотра, редактора или процессора для этих форматов, чтобы была доступна полная поддержка химических типов MIME.

Источники химических данных

Вот краткий список источников свободно доступных молекулярных данных. В Интернете гораздо больше ресурсов, чем перечислено здесь. Ссылки на эти источники приведены в ссылках ниже.

1. База данных Национального института здравоохранения СШАPubChem является огромным источником химических данных. Все данные представлены в двух измерениях. Данные включают в себя форматы SDF, SMILES, PubChem XML и PubChem ASN1.
2. Всемирный банк данных по белкам (wwPDB ) — отличный источник данных о координатах молекул белков и нуклеиновых кислот. Данные трехмерны и представлены в формате банка данных белков (PDB).
3. eMolecules — коммерческая база данных для молекулярных данных. Данные включают двумерную структурную схему и строку улыбок для каждого соединения. eMolecules поддерживает быстрый поиск субструктур на основе частей молекулярной структуры.
4. — коммерческая база данных молекулярных данных. Результаты поиска включают в себя двумерную структурную схему и файл-моль для многих соединений. Библиотека трехмерных молекулярных структур .
5. Агентство по охране окружающей среды США Информационные системы MDL (июнь 2005 г.), CTFile Formats (PDF), Сан-Леандро, Калифорния, США: MDL Information Systems , заархивировано из исходного (PDF) 30 июня 2007 г.
6. «Разрешить структурный идентификатор как SDF, CML, MRV, PDB» . NCI . NIH : Инструменты и услуги для пользователей CADD Group Chemoinformatics (CACTUS). Июль 2009 г.

Mdl number что это

Словарь обозначений . 2014 .

Смотреть что такое «MDL» в других словарях:

MDL — steht für: Moldawischer Leu, Währung Moldawiens IATA Code des Flughafen Mandalay International Airport in Myanmar (früher: Birma oder Burma) Minimal oder Minimum Description Length, englisch für Minimale Beschreibungslänge , ein Maß für die… … Deutsch Wikipedia

MDL — may mean: * MDL (programming language), a derivative of the LISP language * MDL Information Systems, a scientific information management company originally known as Molecular Design Limited * Military Demarcation Line, a truce border line between … Wikipedia

mdl. — mdl. mdl. (fork. for mandlig og månedlig) … Dansk ordbog

MDL — See: multidistrict litigation Category: Accidents & Injuries Category: Dangerous Products & Drugs Category: If, When & Where to File a Lawsuit Nolo’s Plain English Law Dictionary. Gerald N. Hill, Kathleen Thompson Hill … Law dictionary

MdL — MdL, M. d. L. = Mitglied des Landtages … Die deutsche Rechtschreibung

MDL — Cette page d’homonymie répertorie les différents sujets et articles partageant un même nom.   Sigles d’une seule lettre   Sigles de deux lettres > Sigles de trois lettres   Sigles de quatre lettres … Wikipédia en Français

MdL — Mitglied des Landtages; Landtagsabgeordneter * * * MdL 〈Abk. für〉 Mitglied des Landtages * * * M. d. L., MdL = Mitglied des Landtages. * * * MdL, Abkürzung für Mitglied des Landtags. * * … Universal-Lexikon

MdL — Mitglied des Landtages (MdL) ist die amtliche Bezeichnung für einen Abgeordneten im Landesparlament eines deutschen Bundeslandes bzw. historisch eines der Länder des Deutschen Reichs (siehe Landtage der Weimarer Republik). „Landtagsabgeordneter“… … Deutsch Wikipedia

MdL — Abk. für Mitglied des (eines) Landtags (⇡ Abgeordneter). Literatursuche zu MdL auf www.gabler.de … Lexikon der Economics

MDL Information Systems — MDL Information Systems, a provider of R D informatics offerings for the life sciences and chemicals industries and acquired by Symyx Technologies, Inc. in 2007, was launched as a computer aided drug design firm (originally named Molecular Design … Wikipedia

MDL (programming language) — MDL (the MIT Design Language) is a descendant of the Lisp Programming language. Its initial purpose was to provide high level language support for the Dynamic Modeling Group at MIT s Project MAC. It was initially developed in 1971 on the PDP 10… … Wikipedia

Химический формат файла — Chemical file format

В этой статье обсуждаются некоторые распространенные форматы молекулярных файлов, включая использование и преобразование между ними.

Содержание

• 1 Отличительные форматы
• 2 Язык химической разметки
• 3 Формат банка данных белков
• 4 Формат GROMACS
• 5 Формат CHARMM
• 6 Формат GSD
• 7 Формат химического файла
• 8 SYBYL Line Notation
• 9 SMILES
• 10 XYZ
• 11 MDL number
• 12 Другие распространенные форматы
• 13 Преобразование между форматами
• 14 The Chemical MIME Project
  • 14.1 Поддержка

  Отличительные форматы

  Химическая информация обычно предоставляется в виде файлов или потоки и множество форматов были созданы с разной степенью документации. Формат указывается тремя способами (см. Химический раздел MIME).

  • расширение файла (обычно 3 буквы). Это широко используется, но хрупко, поскольку общие суффиксы, такие как «.mol» и «.dat», используются во многих системах, в том числе нехимических.
  • файлы с самоописанием, в которых информация о формате включена в файл. Примерами являются CIF и CML.
  • химический / MIME-тип, добавленный химически осведомленным сервером.

  Язык химической разметки

  Язык химической разметки (CML) — это открытый стандарт для представления молекулярных и другие химические данные. Проект с открытым исходным кодом включает XML-схему, исходный код для анализа и работы с данными CML, а также активное сообщество. В статьях «Инструменты для работы с языком химической разметки» и «XML для химии и биологических наук» CML обсуждается более подробно. Файлы данных CML поддерживаются многими инструментами, в том числе JChemPaint, Jmol, XDrawChem и MarvinView.

  Формат банка данных о белках

  Формат банка данных о белках обычно используется для белков, но его можно использовать и для других типов молекул. Первоначально он был разработан и остается форматом с фиксированной шириной столбца и, таким образом, официально имеет встроенное максимальное количество атомов, остатков и цепей; это привело к разделению очень больших структур, таких как рибосомы, на несколько файлов. Однако многие инструменты могут читать файлы, превышающие эти ограничения. Например, в 2009 г. рибосома E. coli 70S была представлена ​​в виде 4 файлов PDB: 3I1M, 3I1N, 3I1O и 3I1P. В 2014 году они были объединены в один файл, 4V6C.

  Некоторые файлы PDB содержат дополнительный раздел, описывающий связь атома, а также положение. Поскольку эти файлы иногда используются для описания макромолекулярных сборок или молекул, представленных в явном растворителе, они могут становиться очень большими и часто сжимаются. Некоторые инструменты, такие как Jmol и KiNG, могут читать файлы PDB в формате gzip. WwPDB поддерживает спецификации формата файла PDB и его альтернативы XML, PDBML. В августе 2007 г. произошли довольно серьезные изменения в спецификации формата PDB (до версии 3.0) и устранены многие проблемы с файлами в существующей базе данных. Типичное расширение файла для файла PDB -.pdb, хотя некоторые старые файлы используют.ent или.brk. Некоторые инструменты молекулярного моделирования записывают нестандартные файлы в стиле PDB, которые адаптируют базовый формат к своим потребностям.

  Формат GROMACS

  Семейство форматов файлов GROMACS было создано для использования с программным пакетом молекулярного моделирования GROMACS. Он очень похож на формат PDB, но был разработан для хранения результатов моделирования молекулярной динамики, поэтому он обеспечивает дополнительную числовую точность и, при необходимости, сохраняет информацию о скорости частицы, а также о положении в заданном точка на траектории моделирования. Он не позволяет хранить информацию о подключении, которая в GROMACS получается из отдельных файлов молекулы и системной топологии. Типичное расширение файла GROMACS -.gro.

  Формат CHARMM

  Пакет молекулярной динамики CHARMM может считывать и записывать ряд стандартных химических и биохимических форматов файлов; однако CARD (координата) и PSF (файл структуры белка ) в значительной степени уникальны для CHARMM. Формат CARD имеет фиксированную ширину столбца, напоминает формат PDB и используется исключительно для хранения атомарных координат. Файл PSF содержит информацию об атомных связях (которая описывает атомные связи) и требуется перед началом моделирования. Обычно используются файлы с расширениями.crd и.psf соответственно.

  Формат GSD

  Формат файла общих данных моделирования (GSD), созданный для эффективного чтения / записи общих имитаций частиц, в первую очередь — но не ограничиваясь — теми из них. Пакет также содержит модуль python, который читает и записывает gsd-файлы схемы hoomd с простым в использовании синтаксисом. [1]

  Формат файла Ghemical

  Программное обеспечение Ghemical может использовать OpenBabel для импорта и экспорта ряда форматов файлов. Однако по умолчанию он использует формат GPR. Этот файл состоит из нескольких частей, разделенных тегом (! Header,! Info,! Atoms,! Bonds,! Coord,! PartialCharges и! End).

  Предлагаемый тип MIME для этого формата — application / x-ghemical.

  Обозначение строки SYBYL

  Обозначение строки SYBYL (SLN) — это химическое обозначение строки . Основанный на SMILES, он включает полный синтаксис для определения относительной стереохимии. SLN имеет богатый синтаксис запросов, который позволяет специфицировать запросы структуры Маркуша. Синтаксис также поддерживает спецификацию комбинаторных библиотек ChemDraw.

  Описание	Строка SLN
  Бензол	C [1] H: CH: CH: CH: CH: CH: @ 1
  Alanine	NH2C [s = n] H (CH3) C (= O) OH
  Запрос, показывающий боковую цепь R	R1 [hac>​​1] C [1]: C: C: C: C: C: @ 1
  Запрос амида / сульфамида	NHC = M1

  УЛЫБКА

  Sподразумевается M olecular I nput L ine E ntry S pecification (SMILES) — это строковое обозначение для молекулы. Строки SMILES включают возможность подключения, но не включают 2D или 3D координаты.

  Атомы водорода не представлены. Другие атомы представлены символами их элементов B, C, N, O, F, P, S, Cl, Br и I. Символ «=» представляет двойные связи, а «#» представляет тройные связи. Ветвление обозначено (). Кольца обозначаются парами цифр.

  Имя	Формула	SMILES Строка
  Метан	CH4	C
  Этанол	C2H6O	CCO
  Бензол	C6H6	C1 = CC = CC = C1 или c1ccccc1
  Этилен	C2H4	C = C

  Формат файла XYZ — это простой формат, который обычно дает количество атомов в первом строка, комментарий ко второй, за которым следует ряд строк с атомными символами (или атомными числами) и декартовыми координатами.

  Номер MDL

  Номер MDL содержит уникальный идентификационный номер для каждой реакции и варианта. Формат — RXXXnnnnnnnn. R указывает на реакцию, XXX указывает, какая база данных содержит запись реакции. Числовая часть, nnnnnnnn, представляет собой 8-значное число.

  Другие распространенные форматы

  Одним из наиболее широко используемых промышленных стандартов являются форматы файлов химических таблиц, такие как файлы формата данных структуры (SDF). Это текстовые файлы, которые соответствуют строгому формату для представления нескольких записей химической структуры и связанных полей данных. Формат был первоначально разработан и опубликован Molecular Design Limited (MDL). MOL — это еще один формат файлов от MDL. Он задокументирован в главе 4 документа CTfile Formats.

  PubChem также имеет форматы файлов XML и ASN1, которые представляют собой параметры экспорта из онлайн-базы данных PubChem. Оба они основаны на тексте (чаще всего ASN1 — это двоичный формат).

  В таблице ниже перечислено большое количество других форматов.

  Преобразование между форматами

  OpenBabel и JOELib являются свободно доступными инструментами с открытым исходным кодом, в частности предназначен для преобразования между форматами файлов. Их химические экспертные системы поддерживают большие таблицы преобразования типов атомов.

  babel -i input_format input_file -o output_format output_file

  Например, чтобы преобразовать файл epinephrine.sdf из SDF в CML, используйте команду

  babel -i sdf epinephrine.sdf -o cml epinephrine.cml

  Полученный файл — epinephrine.cml.

  Ряд инструментов, предназначенных для просмотра и редактирования молекулярных структур, могут читать файлы в нескольких форматах и ​​записывать их в других форматах. Инструменты JChemPaint (на основе Chemistry Development Kit ), XDrawChem (на основе OpenBabel ), Chime, Jmol, Mol2mol и Discovery Studio попадают в эту категорию.

  Проект Chemical MIME

  «Химический MIME» — это де-факто подход для добавления типов MIME к химическим потокам.

  Этот проект стартовал в январе 1994 г. и впервые был объявлен во время семинара по химии на Первой международной конференции WWW, состоявшейся в ЦЕРНе в мае 1994 г. Первая версия черновика в Интернете была опубликована в мае – октябре 1994 г. и вторая исправленная версия в период с апреля по сентябрь 1995 г. Документ, представленный CPEP (Комитет по печатным и электронным публикациям) на заседании IUPAC в августе 1996 г., доступен для обсуждения.

  В 1998 г. работа была официально опубликована в JCIM.

  Расширение файла	MIME Тип	Имя собственное	Описание
  alc	chemical / x-alchemy	Формат Alchemy
  csf	chemical / x-cache-csf	CAChe MolStruct CSF
  cbin, cascii, ctab	chemical / x-cactvs- двоичный	формат CACTVS
  cdx	chemical / x-cdx	ChemDraw eXchange file
  cer	chemical / x-cerius	Формат MSI Cerius II
  c3d	chemical / x-chem3d	Формат Chem3D
  ch m	chemical / x-chemdraw	ChemDraw file
  cif	chemical / x-cif	Файл кристаллографической информации, структура кристаллографической информации	Обнародовано Международным союзом кристаллографии
  cmdf	chemical / x-cmdf	Формат данных CrystalMaker
  cml	химикат / x-cml	Язык химической разметки	XML на основе Язык химической разметки.
  cpa	chemical / x-compass	Программа Compass программы Takahashi
  bsd	химический / x-crossfire	файл Crossfire
  csm, csml	химический / x-csml	язык разметки химического стиля
  ctx	chemical / x-ctx	Формат файла CTX группы Gasteiger
  cxf, cef	chemical / x-cxf	Формат обмена химическими веществами
  emb, embl	chemical / x-embl-dl-nucleotide	EMBL Nucleotide Format
  spc	chemical / x-galactic-spc	Формат SPC для спектральных и хроматографических данных
  inp, gam, gamin	ch emical / x-gamess-input	GAMESS Формат ввода
  fch, fchk	chemical / x-gaussian-checkpoint	Gaussian Формат контрольной точки
  cub	химический / x-gaussian-cube	Gaussian формат куба (волновая функция)
  gau, gjc, gjf, com	химический / x-gaussian-input	гауссовский Формат ввода
  gcg	химический / x-gcg8-последовательность	Формат белковой последовательности
  gen	химический / x-genbank	Формат ToGenBank
  istr, ist	chemical / x-isostar	Библиотека межмолекулярных взаимодействий IsoStar
  jdx, dx	chemical / x-jcamp- dx	JCAMP Формат обмена спектроскопическими данными
  kin	химический / x-kinemage	кинетические изображения (структура белка); Kinemage
  mcm	химический / x-макромолекула	Формат файла макромолекулы
  mmd, mmod	химический / x-макромодель-ввод	Макромодель Молекулярная механика
  моль	химикат / x-mdl-molfile	MDL Molfile
  улыбается, smi	химикат / x-daylight-smiles	Упрощенная спецификация ввода строки молекулярного ввода	Обозначение строки для молекул.
  sdf	chemical / x-mdl-sdfile	Файл структурных данных
  el	chemical / x-sketchel	SketchEl Molecule
  ds	химикат / х-таблица данных	SketchEl XML DataSheet
  inchi	химический / x-inchi	Международный химический идентификатор IUPAC
  jsd, jsdraw	chemical / x-jsdraw	Формат файла JSDraw
  helm, ihelm	chemical / x-helm	Pistoia Alliance HELM строка	Обозначение строки для биологических молекул
  xhelm	chemical / x-xhelm	Pistoia Alliance XHELM XML-файл	XML на основе HELM, включая определения мономеров

  Поддержка

  Для Linux / Unix файлы конфигурации доступны в виде пакета «chemical-mime-data» в .deb, RPM и форматы tar.gz для регистрации химических типов MIME на веб-сервере. Затем программы могут зарегистрироваться в качестве средства просмотра, редактора или процессора для этих форматов, чтобы была доступна полная поддержка химических типов MIME.

  Источники химических данных

  Вот краткий список источников свободно доступных молекулярных данных. В Интернете гораздо больше ресурсов, чем перечислено здесь. Ссылки на эти источники приведены в ссылках ниже.

  1. База данных Национального института здравоохранения СШАPubChem является огромным источником химических данных. Все данные представлены в двух измерениях. Данные включают в себя форматы SDF, SMILES, PubChem XML и PubChem ASN1.
  2. Всемирный банк данных по белкам (wwPDB ) — отличный источник данных о координатах молекул белков и нуклеиновых кислот. Данные трехмерны и представлены в формате банка данных белков (PDB).
  3. eMolecules — коммерческая база данных для молекулярных данных. Данные включают двумерную структурную схему и строку улыбок для каждого соединения. eMolecules поддерживает быстрый поиск субструктур на основе частей молекулярной структуры.
  4. — коммерческая база данных молекулярных данных. Результаты поиска включают в себя двумерную структурную схему и файл-моль для многих соединений. Библиотека трехмерных молекулярных структур.
  5. Агентство по охране окружающей среды США Последняя правка сделана 2021-05-09 07:32:00

  Mdl number что это

  т.е. не препарата, а этой самой примеси (impurity)

  т.е. это вещество у них обозначается "MDL 46,619"

  Мое предположение: MDL — это приставка, использовавшаяся компанией Hoechst (сейчас она вроде бы стала частью Sanofi Aventis). В частности, показательно, что большинство упомянутых веществ: MDL 16,455, MDL 63,042, MDL 63,246 — хорошо гуглятся в сочетании с Hoechst.

  

  Grading comment

  Максим, спасибо за ценную помощь! За этот ответ присуждено 4 очка KudoZ

  

  

  

  

  

  

  

  

  

  может быть, также, "maximum DETECTABLE limit".

  induction periods, the complex dependence of reaction to impurities, . maximum detectable limit, all during the spring and summer initiatives. .
  www.lib.ncsu.edu/theses/available/etd-08152006-140153/unres.

  если, всё же "doping", то в значении "разбавление", "подмешивание", и тогда перевод "MDL" будет, видимо, таким: "максимальный предел загрязнения / разбавления"

  

  есть и СОВСЕМ иная версия. Она основана на следующей публикации: http://aac.asm.org/cgi/reprint/39/10/2176.pdf , в которой можно встретить, напр., следующие выражения:

  "The antibiotic MDL 63,246 (11) is the dimethylaminopropylamide
  derivative of natural glycopeptide MDL 62,476. "

  "New semi-synthetic glycopeptides MDL 63,246 and MDL 63,042. "

  В этом случае, разумеется, переводить "MDL" не следует.

  

  Мне кажется, это подходящая рпсшифровка для данной аббревиатуры. Не знаю, какой вариант лучше (более адекватный), но судя по приведенным источникам, чаще пользуются вторым (Minimum Detection Limit).

  MDL Minimum Detectable Level
  MDL Minimum Detection Limit

  http://www.iop.org/EJ/abstract/0031-9155/40/9/007
  Analysis of the data was performed using several definitions of a minimum detectable limit (MDL) to recode data below the MDL, and using all of the continuous point estimates of lead concentration in the phantom (including negative estimates).

  http://www.epa.gov/nerlcwww/m_200_5.pdf
  METHOD DETECTION LIMIT (MDL) — The minimum concentration of an analyte that can be identified, measured, and reported with 99% confidence that the analyte concentration is greater than zero (Sects. 1.11, 1.12, 9.2.5 and Table 4).

  www.rsnz.org/publish/nzjz/1994/40.pdf
  Fig. 1 Seasonal variation in plasma concentration of
  corticosterone (mean ± SE) in wild juvenile male tuatara
  on Stephens Island, from February 1992 to January 1993.
  Sample sizes are given at the base of each bar. (MDL =
  minimum detectable level.)

  

  Пояснение:
  Подозреваю, что это код исследуемого вещества, соответственно его следует оставлять латиницей.

  т.е. не препарата, а этой самой примеси (impurity)

  т.е. это вещество у них обозначается "MDL 46,619"

  Мое предположение: MDL — это приставка, использовавшаяся компанией Hoechst (сейчас она вроде бы стала частью Sanofi Aventis). В частности, показательно, что большинство упомянутых веществ: MDL 16,455, MDL 63,042, MDL 63,246 — хорошо гуглятся в сочетании с Hoechst.

  Насчет Elsevier MDL — немного смущает, что для того же фексофенидина "MDL 16455" указывается в качестве синонима, а значение параметра "MDL number" совсем другое:
  MFCD00865710
  см. http://www.sigmaaldrich.com/catalog/search/ProductDetail/SIG.

  

  Grading comment

  Максим, спасибо за ценную помощь!

  Login or register (free and only takes a few minutes) to participate in this question.

  You will also have access to many other tools and opportunities designed for those who have language-related jobs (or are passionate about them). Participation is free and the site has a strict confidentiality policy.

  Читать:

  Какой температурой выпаивать светодиоды